Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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