Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms