Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RxraP28700 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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