Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
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