Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm10378F6XQQ1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm10378F6XQQ1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm10378F6XQQ1 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm10378F6XQQ1 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm10378F6XQQ1 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm10378F6XQQ1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm10378F6XQQ1 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm10378F6XQQ1 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10378F6XQQ1 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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