Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms