Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB27

Yod1, Ubiquitin thioesterase OTU1, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yod1Q8CB27 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm37893-201ENSMUST00000192826 2437 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Yod1Q8CB27 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms