Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms