Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Trp53i11Q4QQM4 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Trp53i11Q4QQM4 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Trp53i11Q4QQM4 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Trp53i11Q4QQM4 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Trp53i11Q4QQM4 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Trp53i11Q4QQM4 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Trp53i11Q4QQM4 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Trp53i11Q4QQM4 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Trp53i11Q4QQM4 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Trp53i11Q4QQM4 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Trp53i11Q4QQM4 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 613.8 ms