Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms