Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp4P35123 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp4P35123 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp4P35123 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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