Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms