Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trip6Q9Z1Y4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms