Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ilf3Q9Z1X4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms