Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1K7

Apc2, Adenomatous polyposis coli protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apc2Q9Z1K7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apc2Q9Z1K7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apc2Q9Z1K7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apc2Q9Z1K7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms