Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek4Q9Z1J2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms