Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf1Q9Z1B8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 403 ms