Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1A9

Tbc1d8, TBC1 domain family member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d8Q9Z1A9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d8Q9Z1A9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d8Q9Z1A9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d8Q9Z1A9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d8Q9Z1A9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d8Q9Z1A9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d8Q9Z1A9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d8Q9Z1A9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d8Q9Z1A9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d8Q9Z1A9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d8Q9Z1A9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d8Q9Z1A9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tbc1d8Q9Z1A9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d8Q9Z1A9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms