Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pmfbp1Q9WVQ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms