Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp46a1Q9WVK8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms