Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VapaQ9WV55 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VapaQ9WV55 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms