Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
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ArcQ9WV31 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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ArcQ9WV31 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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ArcQ9WV31 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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ArcQ9WV31 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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ArcQ9WV31 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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ArcQ9WV31 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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ArcQ9WV31 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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ArcQ9WV31 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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ArcQ9WV31 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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ArcQ9WV31 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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ArcQ9WV31 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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ArcQ9WV31 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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ArcQ9WV31 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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ArcQ9WV31 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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ArcQ9WV31 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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ArcQ9WV31 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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ArcQ9WV31 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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