Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUA2

Farsb, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsbQ9WUA2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FarsbQ9WUA2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FarsbQ9WUA2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms