Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AtrnQ9WU60 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AtrnQ9WU60 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtrnQ9WU60 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms