Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sorbs3Q9R1Z8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sorbs3Q9R1Z8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sorbs3Q9R1Z8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms