Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed2Q9R0Q3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms