Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nek3Q9R0A5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms