Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gpc6Q9R087 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gpc6Q9R087 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gpc6Q9R087 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gpc6Q9R087 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc6Q9R087 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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