Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab1Q9R078 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms