Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a3Q9QZS0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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