Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms