Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxe3Q9QY14 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms