Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rad18Q9QXK2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms