Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Apbb1Q9QXJ1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms