Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2lQ9JME7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms