Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrfQ9JM73 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms