Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms