Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CtsmQ9JL96 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms