Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Gde1Q9JL56 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Gde1Q9JL56 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Gde1Q9JL56 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Gde1Q9JL56 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Gde1Q9JL56 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Gde1Q9JL56 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gde1Q9JL56 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gde1Q9JL56 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gde1Q9JL56 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gde1Q9JL56 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gde1Q9JL56 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gde1Q9JL56 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Gde1Q9JL56 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Gde1Q9JL56 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gde1Q9JL56 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gde1Q9JL56 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Gde1Q9JL56 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gde1Q9JL56 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Gde1Q9JL56 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gde1Q9JL56 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Gde1Q9JL56 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Gde1Q9JL56 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Gde1Q9JL56 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms