Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Upk3aQ9JKX8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms