Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Scamp4Q9JKV5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scamp4Q9JKV5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp4Q9JKV5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms