Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms