Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbr1Q9JIT0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms