Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Rb1cc1Q9ESK9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rb1cc1Q9ESK9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms