Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ube3bQ9ES34 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3bQ9ES34 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms