Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dap3Q9ER88 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms