Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn12Q9ER56 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms