Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r63Q9EPT1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms