Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap3s1Q9DCR2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3s1Q9DCR2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3s1Q9DCR2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms