Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fundc1Q9DB70 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fundc1Q9DB70 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fundc1Q9DB70 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms